1984'de İstanbul Üniversitesi Tıp Fakültesi'ni kazanır ve 1990 yılında tıp doktoru olarak mezun olur. İçindeki halkoyunları tutkusuyla yanıp tutuşan Alper Aksoy, öğrenciliği sırasında da Eminönü, Beşiktaş Halk Eğitim Merkezi, Galatasaray Lisesi, Marmara Üniversitesi, Kartal, Ataköy Folklor Derneği, Türk Folklor Kurumu, Özel İtalyan Lisesi, Boğaziçi Üniversitesi gibi pekçok yerde halkoyunları ekipleri çalıştırır.
Bu ekiplerle yarışmalara girer ve o artık bu dalda babası gibi halkoyunları dalında vazgeçilmez kişilerden biridir.
Daha lisede iken çalıştırdığı Gazipaşa İlkokulu ekibiyle Türkiye üçüncüsü olan Alper Aksoy, İstanbul'da çalıştırdığı ekiplerle de dereceler alır ama o artık dansın evrenselliğini ön plana çıkarmaya başlar.
Daha sonra Mustafa Erdoğan ile tanışarak "Sultans of tha Dance" isimli proje ile Anadolu Ateşi ekibinin ilk zamanlarında başladığı çalışmalarını bugün de sürdürmektedir.
